根据专家说法：保留北顶娘娘庙是充分尊重民俗文化和历史，可按照最初规划，这座庙本该被拆除的，怎料过程中发生了一些非常可怕的事情，甚至造成了人员伤亡。
传说中专门研究超自然科学的国家神秘机构749局在这起事件中罕见地露了面，然而这一次，749局也选择了“低头”，认为对方惹不起，提出了妥协建议。
最终，水立方被整体向北平移了100米，造成了如今奥林匹克公园的格局。
不少人相信，当年发生的事情在科学之外。
2004年8月27日下午，一伙工人来到北顶娘娘庙前，打算动手将它拆除。
这座庙宇很有年头，虽然历史上多次修缮，但仍透出浓重的历史沧桑感，甚至可以说是破败。
虽然古建筑意义非凡，拆一座少一座，让人非常心疼，可在城市发展过程中，这样的牺牲又是无法避免的。
工人干劲十足，效率非常高，没多久便推倒了庙门。就在准备进行下一步计划时，变故发生了。
当天晴空万里，就在庙门轰然倒塌之时，天色骤然暗了下来，霎那间竟宛如黑夜。与此同时，不知从哪儿刮起一阵妖风，飞沙走石，令人伸手都看不清五指。只见空中形成一股龙卷风，飞快地向拆迁工地迫近，工人们还没反应过来便被卷入其中。
龙卷风持续了十来分钟，恢复平静后，众人忙跑过去查看情况，眼前的场面让人不忍直视。
据一些未经证实的传闻：当时工地上共有2人死亡（后改成重伤），43人受伤，事发不久，现场便停满了救护车。
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